Área de fortalecimiento Institucional (Nawal E, la energía del liderazgo)

Es el área encargada de fortalecer la institucionalidad de la Plataforma de Mujeres Indígena y de generar propuestas para la sostenibilidad de los procesos que se impulsan.

Área de Diálogo Político y Social (Nawal Tz'", el valor de la palabra)

La Plataforma de Mujeres Indígenas es impulsora de diálogos al más alto nivel con los distintos actores de la gobernanza política, de la economia y los actores y sectores sociales del país, así como con las instancias internacionales.

Área de Alianzas Estratégicas
(Nawal Aq'ab'al, la complementariedad)

La Plataforma de Mujeres Indígenas es impulsora de diálogos al más alto nivel con los distintos actores de la gobernanza política, de la economia y los actores y sectores sociales del país, así como con las instancias internacionales.

Escuelas de formación y Centros de Investigación
(Nawal No'j, la sabiduría y el conocimiento)

Las Escuelas de Formación y Centros de Investigación son las instancias donde se teoriza y aplica el conocimiento para la formación de profesionales especialmente indígenas, que hacen incidencia en materia de derechos de los pueblos indígenas en los distintos ámbitos de trabajo. Además, son los órganos de investigación de donde se generan las propuestas más importantes para el actuar de las lideresas de la Plataforma de Mujeres Indígenas, en su incidencia en los programas y políticas públicas.
Son conducidos por profesionales y científicos sociales que tienen como misión en contribuir a erradicar las brechas abismales de desigualdad del país, que buscan propuestas innovadoras en los campos de la política, la cultura, la economía y la educación de los pueblos indígenas del país y por ende contribuir a evitar la migración hacia otros países.
Las escuelas y centros de investigación, son los gestores del conocimiento, son los medios en donde el conocimiento es dinámico en su gestación, construcción y reconstrucción para el fortalecimiento de la gobernabilidad y el Estado de Derecho, con una plena participación equitativa de los pueblas indígenas.
Las Escuelas de Formación y Centros de Investigación tienen como punto de partida los conocimientos, las ciencias, las tecnologías y saberes ancestrales de los pueblos indígenas, en la formulación de propuestas de programas y políticas públicas en un estado plural..

Escuela de formación y centro de investigación de Gobernanza 

Se representa por el Nawal K'at del calendario maya, que indica interrelaciones, interdependencia, también es
autoridad e indica que todo está unido. El nawal K'at nos recuerda que, mientras tengamos más relaciones mejor nos entendemos y mejor entendemos la vida.
La Escuela de Formación y Centro de Investigación de Gobernanza, se ocupa de la formación de lideresas indígenas y la investigación en las temáticas de la administración y políticas públicas, en la gobernabilidad, la democracia, la política, con énfasis en la participación política de los pueblos indígenas, especialmente de las mujeres indígenas.

Escuela de formación y centro de investigación de Tierra y Territorio.

Se representa por el Nawal I'x del calendario maya, que representa la Madre Naturaleza, la Madre tierra, el respeto y la esencia de la energía femenina.
La Escuela de Formación y Centro de Investigación de Tierra y
Territorio, tiene a su cargo la formación e investigación en las temáticas del acceso, conflictos y tenencia de la tierra, las tierras comunales, el medio ambiente, el cambio climático y el acceso al agua y saneamiento.

Escuela de formación y centro de investigación de Negocios

Se representa por el Nawal Tzikin del calendario maya, que es la esencia de la riqueza material y espiritual como complementos para encontrar la plenitud de la vida. Es el nawal que tiene que ver con la economía y la abundancia, de todo lo que debe tener esencia sin dañar el entorno natural.
La Escuela de Formación y Centro de Investigación de
Negocios tiene a su cargo la formación e investigación en la economía indígena, la producción,el desarrollo, las finanzas, el empleo y el comercio de los pueblos indígenas y su contribución al desarrollo del país. Los pueblos indígenas necesitan de una definición propia del desarrollo desde su condición cultural en congruencia con el mundo global y cómo el Estado debe desarrollar políticas públicas que respondan a esta perspectiva cultural de los puerios.

Escuela de formación y centro de investigación de Pluralismo Jurídico

Se representa por el Nawal Tzi del calendario maya, que representa el valor de la palabra, del consejo y que significa la vara de la autoridad, la justicia y la manifestación del orden.
La Escuela de Formación y Centros de Investigación de
Pluralismo Jurídico tiene a su cargo la formación e
investigación en el campo del Estado de Derecho, el Derecho y el Estado, el Derecho Indígena, el Pluralismo Jurídico, el Litigio Estratégico y la interrelacionalidad entre las autoridades indígenas y las autoridades estatales.